Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LDLRAP1Q5SW96 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LDLRAP1Q5SW96 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms