Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE5

NUP188, Nucleoporin NUP188 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP188Q5SRE5 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NUP188Q5SRE5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NUP188Q5SRE5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms