Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PCID2Q5JVF3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms