Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTC6

AMER1, APC membrane recruitment protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,135 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER1Q5JTC6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 KC6-207ENST00000600644 2311 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMER1Q5JTC6 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMER1Q5JTC6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms