Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PDLIM3Q53GG5 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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