Protein–RNA interactions for Protein: Q52MB2

CCDC184, Coiled-coil domain-containing protein 184, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC184Q52MB2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC184Q52MB2 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC184Q52MB2 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC184Q52MB2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC184Q52MB2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC184Q52MB2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC184Q52MB2 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC184Q52MB2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC184Q52MB2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC184Q52MB2 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CCDC184Q52MB2 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms