Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
SP6Q3SY56 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
SP6Q3SY56 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms