Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NBPF8Q3BBV2 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NBPF8Q3BBV2 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms