Protein–RNA interactions for Protein: Q29983

MICA, MHC class I polypeptide-related sequence A, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAQ29983 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MICAQ29983 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MICAQ29983 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MICAQ29983 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MICAQ29983 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms