Protein–RNA interactions for Protein: Q16836

HADH, Hydroxyacyl-coenzyme A dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHQ16836 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HADHQ16836 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HADHQ16836 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HADHQ16836 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HADHQ16836 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HADHQ16836 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HADHQ16836 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HADHQ16836 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HADHQ16836 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HADHQ16836 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HADHQ16836 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HADHQ16836 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HADHQ16836 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HADHQ16836 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HADHQ16836 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
HADHQ16836 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HADHQ16836 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HADHQ16836 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HADHQ16836 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HADHQ16836 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HADHQ16836 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HADHQ16836 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
HADHQ16836 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HADHQ16836 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HADHQ16836 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HADHQ16836 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
HADHQ16836 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HADHQ16836 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
HADHQ16836 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms