Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
PMCHL1Q16048 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms