Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ZIC1Q15915 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
ZIC1Q15915 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms