Protein–RNA interactions for Protein: Q15828

CST6, Cystatin-M, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CST6Q15828 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CST6Q15828 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CST6Q15828 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CST6Q15828 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CST6Q15828 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CST6Q15828 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CST6Q15828 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CST6Q15828 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms