Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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SYCP1Q15431 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SYCP1Q15431 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SYCP1Q15431 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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SYCP1Q15431 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.79
SYCP1Q15431 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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SYCP1Q15431 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
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SYCP1Q15431 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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SYCP1Q15431 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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SYCP1Q15431 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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SYCP1Q15431 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
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SYCP1Q15431 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
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SYCP1Q15431 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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SYCP1Q15431 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SYCP1Q15431 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
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