Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
UBE3CQ15386 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
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