Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
PRKD1Q15139 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PRKD1Q15139 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
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