Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PDK3Q15120 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PDK3Q15120 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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