Protein–RNA interactions for Protein: Q14457

BECN1, Beclin-1, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BECN1Q14457 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
BECN1Q14457 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
BECN1Q14457 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
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