Protein–RNA interactions for Protein: Q14152

EIF3A, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3AQ14152 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC25■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EIF3AQ14152 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms