Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CNGB1Q14028 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CNGB1Q14028 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
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