Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAPSNQ13702 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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