Protein–RNA interactions for Protein: Q13642

FHL1, Four and a half LIM domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHL1Q13642 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FHL1Q13642 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FHL1Q13642 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms