Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
FOXE3Q13461 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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FOXE3Q13461 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
FOXE3Q13461 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
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