Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MSLNQ13421 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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