Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATMQ13315 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATMQ13315 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATMQ13315 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATMQ13315 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATMQ13315 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATMQ13315 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATMQ13315 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATMQ13315 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATMQ13315 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATMQ13315 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATMQ13315 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATMQ13315 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATMQ13315 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATMQ13315 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATMQ13315 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATMQ13315 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATMQ13315 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATMQ13315 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATMQ13315 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATMQ13315 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATMQ13315 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATMQ13315 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATMQ13315 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATMQ13315 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATMQ13315 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATMQ13315 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATMQ13315 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATMQ13315 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATMQ13315 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATMQ13315 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATMQ13315 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATMQ13315 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATMQ13315 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATMQ13315 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATMQ13315 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATMQ13315 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATMQ13315 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATMQ13315 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATMQ13315 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATMQ13315 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATMQ13315 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATMQ13315 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATMQ13315 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATMQ13315 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATMQ13315 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATMQ13315 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATMQ13315 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATMQ13315 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATMQ13315 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATMQ13315 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATMQ13315 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATMQ13315 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATMQ13315 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATMQ13315 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ATMQ13315 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ATMQ13315 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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