Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
SRSF6Q13247 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SRSF6Q13247 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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