Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CBX3Q13185 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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