Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 TBC1D15-217ENST00000550746 6184 ntTSL 1 (best) BASIC10.33□□□□□ -0.761e-7■■□□□ 13.9
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TARDBPQ13148 UBR4-202ENST00000375224 3475 ntTSL 2 BASIC7.74□□□□□ -1.171e-7■■□□□ 13.9
TARDBPQ13148 MARK2-213ENST00000540169 558 ntTSL 46.98□□□□□ -1.291e-7■■□□□ 13.9
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TARDBPQ13148 MARK2-214ENST00000543220 595 ntTSL 44.87□□□□□ -1.631e-7■■□□□ 13.9
TARDBPQ13148 TBC1D15-203ENST00000462788 1995 ntTSL 1 (best)4.59□□□□□ -1.671e-7■■□□□ 13.9
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TARDBPQ13148 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.74e-7■■□□□ 13.7
TARDBPQ13148 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.764e-7■■□□□ 13.7
TARDBPQ13148 C21orf91-OT1-202ENST00000430815 717 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.874e-7■■□□□ 13.7
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TARDBPQ13148 SS18-211ENST00000578954 756 ntTSL 315.19■□□□□ 0.022e-8■■□□□ 13.7
TARDBPQ13148 SS18-212ENST00000579061 646 ntTSL 314.79□□□□□ -0.042e-8■■□□□ 13.7
TARDBPQ13148 SS18-206ENST00000577572 510 ntTSL 414.3□□□□□ -0.122e-8■■□□□ 13.7
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TARDBPQ13148 SS18-204ENST00000539244 977 ntTSL 1 (best)13.99□□□□□ -0.172e-8■■□□□ 13.7
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TARDBPQ13148 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.332e-8■■□□□ 13.7
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TARDBPQ13148 SS18-202ENST00000269138 1548 ntTSL 212.41□□□□□ -0.422e-8■■□□□ 13.7
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TARDBPQ13148 SS18-210ENST00000578700 575 ntTSL 510.23□□□□□ -0.772e-8■■□□□ 13.7
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TARDBPQ13148 SS18-213ENST00000579640 1840 ntTSL 210.14□□□□□ -0.792e-8■■□□□ 13.7
TARDBPQ13148 SS18-205ENST00000542420 2321 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.932e-8■■□□□ 13.7
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