Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
GRIK3Q13003 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GRIK3Q13003 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
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