Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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PTPN13Q12923 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PTPN13Q12923 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
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