Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CCDC15Q0P6D6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CCDC15Q0P6D6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms