Protein–RNA interactions for Protein: Q08629

SPOCK1, Testican-1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK1Q08629 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPOCK1Q08629 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms