Protein–RNA interactions for Protein: Q08477

CYP4F3, Docosahexaenoic acid omega-hydroxylase CYP4F3, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F3Q08477 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
CYP4F3Q08477 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
CYP4F3Q08477 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms