Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SLC3A1Q07837 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SLC3A1Q07837 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms