Protein–RNA interactions for Protein: Q05519

SRSF11, Serine/arginine-rich splicing factor 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF11Q05519 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SRSF11Q05519 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SRSF11Q05519 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms