Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TOP2BQ02880 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TOP2BQ02880 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms