Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDR2Q01850 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDR2Q01850 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDR2Q01850 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDR2Q01850 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDR2Q01850 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDR2Q01850 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDR2Q01850 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDR2Q01850 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDR2Q01850 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
CDR2Q01850 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDR2Q01850 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDR2Q01850 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDR2Q01850 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDR2Q01850 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDR2Q01850 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CDR2Q01850 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CDR2Q01850 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms