Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD1P98174 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD1P98174 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD1P98174 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD1P98174 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD1P98174 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD1P98174 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD1P98174 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD1P98174 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD1P98174 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD1P98174 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FGD1P98174 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FGD1P98174 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FGD1P98174 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FGD1P98174 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FGD1P98174 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FGD1P98174 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FGD1P98174 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
FGD1P98174 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms