Protein–RNA interactions for Protein: P63267

ACTG2, Actin, gamma-enteric smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG2P63267 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTG2P63267 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms