Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA2P62736 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms