Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
VBP1P61758 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
VBP1P61758 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
VBP1P61758 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
VBP1P61758 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms