Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
CTBP2P56545 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms