Protein–RNA interactions for Protein: P56539

CAV3, Caveolin-3, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV3P56539 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CAV3P56539 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CAV3P56539 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CAV3P56539 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.6 ms