Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ARFIP1P53367 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms