Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ARFIP2P53365 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms