Protein–RNA interactions for Protein: P52907

CAPZA1, F-actin-capping protein subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA1P52907 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CAPZA1P52907 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms