Protein–RNA interactions for Protein: P49447

CYB561, Cytochrome b561, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYB561P49447 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYB561P49447 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYB561P49447 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYB561P49447 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYB561P49447 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYB561P49447 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYB561P49447 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYB561P49447 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYB561P49447 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYB561P49447 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYB561P49447 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYB561P49447 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYB561P49447 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYB561P49447 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYB561P49447 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYB561P49447 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYB561P49447 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYB561P49447 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CYB561P49447 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CYB561P49447 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CYB561P49447 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYB561P49447 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYB561P49447 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYB561P49447 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYB561P49447 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CYB561P49447 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms