Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
POU3F4P49335 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
POU3F4P49335 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms