Protein–RNA interactions for Protein: P48729

CSNK1A1, Casein kinase I isoform alpha, humanhuman

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1A1P48729 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CSNK1A1P48729 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms