Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NESP48681 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NESP48681 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NESP48681 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
NESP48681 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
NESP48681 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NESP48681 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NESP48681 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NESP48681 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NESP48681 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NESP48681 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NESP48681 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NESP48681 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NESP48681 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
NESP48681 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NESP48681 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NESP48681 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NESP48681 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
NESP48681 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
NESP48681 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NESP48681 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NESP48681 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NESP48681 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NESP48681 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NESP48681 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
NESP48681 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
NESP48681 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC30.63■■■□□ 2.49
NESP48681 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NESP48681 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NESP48681 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NESP48681 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NESP48681 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NESP48681 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NESP48681 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NESP48681 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
NESP48681 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
NESP48681 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NESP48681 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NESP48681 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NESP48681 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NESP48681 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NESP48681 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NESP48681 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
NESP48681 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NESP48681 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
NESP48681 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
NESP48681 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
NESP48681 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NESP48681 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NESP48681 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NESP48681 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NESP48681 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NESP48681 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NESP48681 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NESP48681 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NESP48681 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
NESP48681 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NESP48681 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NESP48681 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NESP48681 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
NESP48681 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
NESP48681 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NESP48681 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NESP48681 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NESP48681 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NESP48681 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NESP48681 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NESP48681 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NESP48681 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
NESP48681 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
NESP48681 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
NESP48681 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
NESP48681 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NESP48681 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NESP48681 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NESP48681 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
NESP48681 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NESP48681 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
NESP48681 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NESP48681 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
NESP48681 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NESP48681 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NESP48681 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NESP48681 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
NESP48681 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
NESP48681 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NESP48681 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
NESP48681 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NESP48681 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NESP48681 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
NESP48681 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
NESP48681 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NESP48681 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
NESP48681 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
NESP48681 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NESP48681 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NESP48681 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
NESP48681 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NESP48681 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
NESP48681 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms